Você pode realmente usar o assistente de migração do Sqlserver. Mas você pode ter problemas mais tarde por causa das configurações de collation. Eu prefiro criar o modelo de dados eu mesmo no Sqlserver. Assim, tenho total controle sobre o tipo de campos que quero usar para otimizar os dados da melhor forma possível.
Depois disso, reconstruí o código no SQL server que está presente no MySQL. Use uma conexão de servidor vinculado ao MySQL para obter os dados no Sqlserver. TSQL e Sqlserver têm mais recursos do que MySQL para melhorar o desempenho. Você não quer perder isso. É menos divertido andar com um cavalo e carruagem em uma pista de corrida. Abraços
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