Avis et détails du produit de Pluto Bio

Pluto me permet d'organiser mes données et d'exécuter des analyses bioinformatiques, sans avoir à coder. Pluto me permet également de créer de bonnes figures représentatives par moi-même. J'aime que toutes mes données puissent être sauvegardées au même endroit et me donne la flexibilité de créer plus de graphiques et d'interprétations au fur et à mesure que j'analyse. J'aime aussi qu'ils aient une fonction de chat réactive qui répond rapidement à mes questions. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

Cela aiderait à effectuer plus de types d'analyses statistiques sur Pluton. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

Notre équipe ayant peu de connaissances sur la façon d'analyser les données transcriptomiques en utilisant des langages de programmation complexes (R, Python). Pluto facilite pour chacun d'entre nous l'examen de nos propres données et la création de diagrammes en barres, de graphiques en volcan, etc. Je reviens fréquemment pour créer de nouvelles figures/analyses comparatives sur mes ensembles de données plus tard lorsque j'ai besoin d'un nouveau graphique. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

Je voudrais voir encore plus de types d'analyse à choisir dans Pluto. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

Pluton est utile pour le partage de données et la visualisation, en particulier pour les essais biologiques 'simples' que je fais. Je peux intégrer plusieurs essais en un seul endroit facile, et ajouter à la fois des images et du texte. C'est basé sur le cloud, donc je peux travailler sur mes données de n'importe où, même depuis mon téléphone (ce que j'ai déjà fait auparavant !). Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

La barrière à l'utilisabilité est assez élevée, je n'ai pas pu intégrer autant de collègues que je l'aurais souhaité.

Les graphiques ne sont pas prêts pour la publication : lorsque les valeurs sont inférieures à 1, aucun décimal n'est affiché. Les légendes ne sont pas modifiables pour plus de clarté et ne peuvent pas inclure d'unités.

Dans le formatage des données d'échantillon, Pluto ne peut pas extraire de valeurs numériques si du texte est inclus. Cela rend impossible l'ajout de 'cibles' comme des concentrations (5uM par exemple).

Pas de modélisation de Bliss ou de courbes d'ajustement pour les IC50. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

I am an experienced bioinformatics researcher that has personally tried numerous analysis and visualization platforms across several -omics types. A huge advantage of this platform is that it is fully end to end. I haven’t encountered another platform that can process large sequencing files, perform quality control, and generate interpretable and publication-quality analysis.

I have shared data through this platform (which is quite easy) to investigators with limited bioinformatics experience. Despite that shortcoming, the platform is so intuitive that they are easily capable of understanding the analysis to that point and are quickly capable of generating new analyses. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

Researchers always want more features and analysis so I would just like to see continued growth. I’ve used this platform for over a year and I have been impressed with the continued growth and development. New experiments and analyses are frequently added, keeping this platform up to date with what is needed for bioinformatics analysis but continued development will be needed.

Extensive quality control is performed. However, because so much information is generated, it can be difficult to quickly know if there are issues with the data. QC notifications could be one area for improvement. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

La partie la plus utile de Pluto est la section des méthodes qui accompagne chaque figure. C'était tellement facile d'écrire le manuscrit lorsque chaque figure a exactement ce qui a été fait pour la créer. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

Il n'y avait vraiment rien que je n'aimais pas, la seule chose que j'aimerais voir est plus d'options pour afficher les données. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

Pluto makes running the more mundane processing parts of NGS analysis easy with very little hands on time from the user. As someone who is a bioinformatician, I do not enjoy running the basic parts of informatics analyses (such as QC and generation of counts matrices), and Pluto allows me to spend a couple minutes uploading the data so I can focus on the more intricate parts of downstream analysis analyses and on software development. They provide very thorough and comprehensive QC metrics, so that if I need to modify or rerun the pipeline, I can easily do that by making a copy of the experiment, changing a couple of parameters, and re-running based on the QC issues I see. I can seriously do this in under 5 minutes of my time. I also think the ability to import GEO studies from fastq through analysis is very powerful and saves me a lot of time trying to download fastqs and dealing with internet bandwidth issues from SRA and re-analyze them to be concordant with the pipelines and parameters I want to use; the platform makes running reproducible analysis much more steamlined. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

I would like to see either more tutorials/docs/video, of how to interpret different portions of the multiqc report and example of when I should be concerned about the QC. Additionally, more experiment types would be great -- some type of streamlined variant calling pipeline (particularly for cancer studies) or scRNA-seq analsis would be nice. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

It's a wet-lab scientist-friendly platform that reduces steps toward the actual analysis!

And staff from pluto are available and pretty responsive for troubleshoot whenever needed Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

More webinars would be appreciated considering the diverse aspects you can explore on the platform. And if it can reflect single cell technology which becomes one of the standard, it would be awesome Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

Pluto allows collaboration across teams. It is very helpful to have all data pertaining to a certain sample visualised in one place. It is a great addition to ELN software where the focus is on protocols and record-keeping rather than visualisation and collaboration. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

When adding new data to Pluto for technical repeats of experiments, a completely new file needs to be uploaded and graphs need to be remade which takes a bit of extra time.

Additionally, decimals are not displayed in graphs on the y-axis. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

Un guichet unique pour tous mes besoins en séquençage d'ARN sans avoir besoin d'être bioinformaticien. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

Rien vraiment. Peut-être qu'au début certaines choses avaient des bugs, mais leur équipe a été formidable pour les corriger, donc ce n'est plus un problème... Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

J'aime la facilité avec laquelle on peut créer un graphique à partir de données RNAseq en vrac. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.

Je souhaite qu'il y ait un bouton de suppression pour les projets créés par erreur dans l'interface utilisateur. Avis collecté par et hébergé sur G2.com.